CIOS berupaya mencetak sumber daya manusia dengan basis keislaman yang kuat sekaligus berwawasan kontemporer. Selain itu, CIOS juga mengembangkan kerangka-pikir (framework) pemikiran Islam, sekaligus melahirkan konsep dan teori baru dalam berbagai disiplin ilmu keislaman berdasarkan konsep pandangan hidup Islam. Tidak hanya itu, CIOS juga terus melahirkan dan menyebarluaskan hasil-hasil penelitian yang otoritatif di bidang kajian Islam (orientalisme) dan Barat (oksidentalisme), seperti keilmuan (filsafat, epistemologi, dan etika), politik, ekonomi, filsafat, pendidikan, seni, dan gender, sebagai respons terhadap berbagai “pemikiran keislaman” yang berasal dari arus kebudayaan, aliran pemikiran, dan ideologi modern.